Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sec22bO08547 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sec22bO08547 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sec22bO08547 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sec22bO08547 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sec22bO08547 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sec22bO08547 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sec22bO08547 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sec22bO08547 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sec22bO08547 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sec22bO08547 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sec22bO08547 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sec22bO08547 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sec22bO08547 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sec22bO08547 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sec22bO08547 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sec22bO08547 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sec22bO08547 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sec22bO08547 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sec22bO08547 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sec22bO08547 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sec22bO08547 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sec22bO08547 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sec22bO08547 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sec22bO08547 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sec22bO08547 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sec22bO08547 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sec22bO08547 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sec22bO08547 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sec22bO08547 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sec22bO08547 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sec22bO08547 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sec22bO08547 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sec22bO08547 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sec22bO08547 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sec22bO08547 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sec22bO08547 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sec22bO08547 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sec22bO08547 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sec22bO08547 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sec22bO08547 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sec22bO08547 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sec22bO08547 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sec22bO08547 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sec22bO08547 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Sec22bO08547 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sec22bO08547 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sec22bO08547 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sec22bO08547 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sec22bO08547 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sec22bO08547 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sec22bO08547 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sec22bO08547 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sec22bO08547 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sec22bO08547 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sec22bO08547 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sec22bO08547 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sec22bO08547 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sec22bO08547 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sec22bO08547 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sec22bO08547 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sec22bO08547 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sec22bO08547 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sec22bO08547 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sec22bO08547 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sec22bO08547 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sec22bO08547 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sec22bO08547 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sec22bO08547 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sec22bO08547 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sec22bO08547 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sec22bO08547 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sec22bO08547 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec22bO08547 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec22bO08547 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sec22bO08547 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sec22bO08547 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sec22bO08547 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sec22bO08547 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sec22bO08547 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sec22bO08547 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sec22bO08547 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sec22bO08547 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sec22bO08547 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sec22bO08547 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms