Protein–RNA interactions for Protein: M0QWJ9

Tmem178b, Transmembrane protein 178B, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem178bM0QWJ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem178bM0QWJ9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem178bM0QWJ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem178bM0QWJ9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem178bM0QWJ9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem178bM0QWJ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem178bM0QWJ9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem178bM0QWJ9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem178bM0QWJ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem178bM0QWJ9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem178bM0QWJ9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem178bM0QWJ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem178bM0QWJ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem178bM0QWJ9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem178bM0QWJ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem178bM0QWJ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem178bM0QWJ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem178bM0QWJ9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem178bM0QWJ9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem178bM0QWJ9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem178bM0QWJ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem178bM0QWJ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem178bM0QWJ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem178bM0QWJ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem178bM0QWJ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem178bM0QWJ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem178bM0QWJ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem178bM0QWJ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem178bM0QWJ9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem178bM0QWJ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem178bM0QWJ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem178bM0QWJ9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem178bM0QWJ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem178bM0QWJ9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem178bM0QWJ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem178bM0QWJ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem178bM0QWJ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms