Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
1700122O11RikJ3QPW6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700122O11RikJ3QPW6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700122O11RikJ3QPW6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700122O11RikJ3QPW6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700122O11RikJ3QPW6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700122O11RikJ3QPW6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
1700122O11RikJ3QPW6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
1700122O11RikJ3QPW6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700122O11RikJ3QPW6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
1700122O11RikJ3QPW6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700122O11RikJ3QPW6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700122O11RikJ3QPW6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700122O11RikJ3QPW6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700122O11RikJ3QPW6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700122O11RikJ3QPW6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700122O11RikJ3QPW6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700122O11RikJ3QPW6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700122O11RikJ3QPW6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700122O11RikJ3QPW6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700122O11RikJ3QPW6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700122O11RikJ3QPW6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700122O11RikJ3QPW6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700122O11RikJ3QPW6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700122O11RikJ3QPW6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700122O11RikJ3QPW6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
1700122O11RikJ3QPW6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700122O11RikJ3QPW6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700122O11RikJ3QPW6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700122O11RikJ3QPW6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
1700122O11RikJ3QPW6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
1700122O11RikJ3QPW6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700122O11RikJ3QPW6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700122O11RikJ3QPW6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700122O11RikJ3QPW6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700122O11RikJ3QPW6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700122O11RikJ3QPW6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700122O11RikJ3QPW6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700122O11RikJ3QPW6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700122O11RikJ3QPW6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
1700122O11RikJ3QPW6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700122O11RikJ3QPW6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700122O11RikJ3QPW6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700122O11RikJ3QPW6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700122O11RikJ3QPW6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700122O11RikJ3QPW6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700122O11RikJ3QPW6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
1700122O11RikJ3QPW6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700122O11RikJ3QPW6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700122O11RikJ3QPW6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700122O11RikJ3QPW6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700122O11RikJ3QPW6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700122O11RikJ3QPW6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700122O11RikJ3QPW6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700122O11RikJ3QPW6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700122O11RikJ3QPW6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700122O11RikJ3QPW6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700122O11RikJ3QPW6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700122O11RikJ3QPW6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
1700122O11RikJ3QPW6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
1700122O11RikJ3QPW6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700122O11RikJ3QPW6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700122O11RikJ3QPW6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
1700122O11RikJ3QPW6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700122O11RikJ3QPW6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700122O11RikJ3QPW6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700122O11RikJ3QPW6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700122O11RikJ3QPW6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700122O11RikJ3QPW6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700122O11RikJ3QPW6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700122O11RikJ3QPW6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700122O11RikJ3QPW6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700122O11RikJ3QPW6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700122O11RikJ3QPW6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700122O11RikJ3QPW6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700122O11RikJ3QPW6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700122O11RikJ3QPW6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700122O11RikJ3QPW6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700122O11RikJ3QPW6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700122O11RikJ3QPW6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700122O11RikJ3QPW6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700122O11RikJ3QPW6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700122O11RikJ3QPW6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700122O11RikJ3QPW6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700122O11RikJ3QPW6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700122O11RikJ3QPW6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700122O11RikJ3QPW6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700122O11RikJ3QPW6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700122O11RikJ3QPW6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700122O11RikJ3QPW6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700122O11RikJ3QPW6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700122O11RikJ3QPW6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700122O11RikJ3QPW6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700122O11RikJ3QPW6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700122O11RikJ3QPW6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.3 ms