Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Usp17lcG5E8I7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Usp17lcG5E8I7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Usp17lcG5E8I7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Usp17lcG5E8I7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Usp17lcG5E8I7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Usp17lcG5E8I7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Usp17lcG5E8I7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Usp17lcG5E8I7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Usp17lcG5E8I7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Usp17lcG5E8I7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Usp17lcG5E8I7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Usp17lcG5E8I7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Usp17lcG5E8I7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Usp17lcG5E8I7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Usp17lcG5E8I7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Usp17lcG5E8I7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Usp17lcG5E8I7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Usp17lcG5E8I7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Usp17lcG5E8I7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Usp17lcG5E8I7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Usp17lcG5E8I7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Usp17lcG5E8I7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Usp17lcG5E8I7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Usp17lcG5E8I7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Usp17lcG5E8I7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Usp17lcG5E8I7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Usp17lcG5E8I7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Usp17lcG5E8I7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Usp17lcG5E8I7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Usp17lcG5E8I7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Usp17lcG5E8I7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Usp17lcG5E8I7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Usp17lcG5E8I7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Usp17lcG5E8I7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Usp17lcG5E8I7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Usp17lcG5E8I7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Usp17lcG5E8I7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Usp17lcG5E8I7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Usp17lcG5E8I7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Usp17lcG5E8I7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Usp17lcG5E8I7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Usp17lcG5E8I7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Usp17lcG5E8I7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp17lcG5E8I7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Usp17lcG5E8I7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Usp17lcG5E8I7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Usp17lcG5E8I7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Usp17lcG5E8I7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Usp17lcG5E8I7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Usp17lcG5E8I7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Usp17lcG5E8I7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Usp17lcG5E8I7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Usp17lcG5E8I7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Usp17lcG5E8I7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Usp17lcG5E8I7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Usp17lcG5E8I7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Usp17lcG5E8I7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Usp17lcG5E8I7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Usp17lcG5E8I7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Usp17lcG5E8I7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Usp17lcG5E8I7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Usp17lcG5E8I7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Usp17lcG5E8I7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Usp17lcG5E8I7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Usp17lcG5E8I7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Usp17lcG5E8I7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Usp17lcG5E8I7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Usp17lcG5E8I7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Usp17lcG5E8I7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Usp17lcG5E8I7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Usp17lcG5E8I7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Usp17lcG5E8I7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Usp17lcG5E8I7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Usp17lcG5E8I7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Usp17lcG5E8I7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp17lcG5E8I7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Usp17lcG5E8I7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Usp17lcG5E8I7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp17lcG5E8I7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Usp17lcG5E8I7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Usp17lcG5E8I7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Usp17lcG5E8I7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Usp17lcG5E8I7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Usp17lcG5E8I7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Usp17lcG5E8I7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Usp17lcG5E8I7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Usp17lcG5E8I7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Usp17lcG5E8I7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Usp17lcG5E8I7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Usp17lcG5E8I7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Usp17lcG5E8I7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Usp17lcG5E8I7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Usp17lcG5E8I7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Usp17lcG5E8I7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Usp17lcG5E8I7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Usp17lcG5E8I7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Usp17lcG5E8I7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Usp17lcG5E8I7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
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