Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip12G5E870 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip12G5E870 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip12G5E870 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip12G5E870 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip12G5E870 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trip12G5E870 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trip12G5E870 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trip12G5E870 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trip12G5E870 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trip12G5E870 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trip12G5E870 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trip12G5E870 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trip12G5E870 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trip12G5E870 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trip12G5E870 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trip12G5E870 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trip12G5E870 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip12G5E870 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip12G5E870 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trip12G5E870 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trip12G5E870 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trip12G5E870 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip12G5E870 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trip12G5E870 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip12G5E870 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trip12G5E870 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trip12G5E870 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trip12G5E870 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trip12G5E870 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip12G5E870 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip12G5E870 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trip12G5E870 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip12G5E870 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip12G5E870 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trip12G5E870 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip12G5E870 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trip12G5E870 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trip12G5E870 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trip12G5E870 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trip12G5E870 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trip12G5E870 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip12G5E870 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trip12G5E870 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trip12G5E870 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trip12G5E870 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip12G5E870 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trip12G5E870 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip12G5E870 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trip12G5E870 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trip12G5E870 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip12G5E870 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trip12G5E870 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip12G5E870 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trip12G5E870 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trip12G5E870 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trip12G5E870 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trip12G5E870 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip12G5E870 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trip12G5E870 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trip12G5E870 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip12G5E870 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip12G5E870 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip12G5E870 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip12G5E870 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip12G5E870 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip12G5E870 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip12G5E870 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip12G5E870 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip12G5E870 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip12G5E870 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip12G5E870 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip12G5E870 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip12G5E870 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip12G5E870 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip12G5E870 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip12G5E870 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip12G5E870 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip12G5E870 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip12G5E870 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip12G5E870 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trip12G5E870 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip12G5E870 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip12G5E870 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip12G5E870 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms