Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Susd5G3UW60 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Susd5G3UW60 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Susd5G3UW60 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Susd5G3UW60 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Susd5G3UW60 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Susd5G3UW60 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Susd5G3UW60 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Susd5G3UW60 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Susd5G3UW60 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Susd5G3UW60 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Susd5G3UW60 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Susd5G3UW60 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Susd5G3UW60 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Susd5G3UW60 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Susd5G3UW60 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Susd5G3UW60 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Susd5G3UW60 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Susd5G3UW60 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Susd5G3UW60 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Susd5G3UW60 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Susd5G3UW60 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Susd5G3UW60 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Susd5G3UW60 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Susd5G3UW60 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Susd5G3UW60 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Susd5G3UW60 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Susd5G3UW60 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Susd5G3UW60 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Susd5G3UW60 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Susd5G3UW60 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Susd5G3UW60 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Susd5G3UW60 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Susd5G3UW60 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Susd5G3UW60 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Susd5G3UW60 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Susd5G3UW60 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Susd5G3UW60 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Susd5G3UW60 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Susd5G3UW60 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Susd5G3UW60 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Susd5G3UW60 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Susd5G3UW60 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Susd5G3UW60 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Susd5G3UW60 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Susd5G3UW60 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Susd5G3UW60 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Susd5G3UW60 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Susd5G3UW60 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Susd5G3UW60 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Susd5G3UW60 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Susd5G3UW60 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Susd5G3UW60 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Susd5G3UW60 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Susd5G3UW60 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Susd5G3UW60 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Susd5G3UW60 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Susd5G3UW60 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Susd5G3UW60 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Susd5G3UW60 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Susd5G3UW60 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Susd5G3UW60 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Susd5G3UW60 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Susd5G3UW60 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Susd5G3UW60 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Susd5G3UW60 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Susd5G3UW60 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Susd5G3UW60 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Susd5G3UW60 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Susd5G3UW60 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Susd5G3UW60 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Susd5G3UW60 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Susd5G3UW60 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Susd5G3UW60 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Susd5G3UW60 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Susd5G3UW60 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Susd5G3UW60 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Susd5G3UW60 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Susd5G3UW60 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Susd5G3UW60 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Susd5G3UW60 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Susd5G3UW60 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Susd5G3UW60 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Susd5G3UW60 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Susd5G3UW60 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Susd5G3UW60 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Susd5G3UW60 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Susd5G3UW60 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Susd5G3UW60 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Susd5G3UW60 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Susd5G3UW60 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Susd5G3UW60 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Susd5G3UW60 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Susd5G3UW60 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Susd5G3UW60 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Susd5G3UW60 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Susd5G3UW60 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Susd5G3UW60 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Susd5G3UW60 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Susd5G3UW60 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms