Protein–RNA interactions for Protein: F7CXE4

Gm7535, Predicted gene 7535, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7535F7CXE4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm7535F7CXE4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm7535F7CXE4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm7535F7CXE4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm7535F7CXE4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm7535F7CXE4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm7535F7CXE4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm7535F7CXE4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm7535F7CXE4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm7535F7CXE4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm7535F7CXE4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm7535F7CXE4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm7535F7CXE4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm7535F7CXE4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm7535F7CXE4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm7535F7CXE4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm7535F7CXE4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm7535F7CXE4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm7535F7CXE4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm7535F7CXE4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm7535F7CXE4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm7535F7CXE4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm7535F7CXE4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm7535F7CXE4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm7535F7CXE4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm7535F7CXE4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm7535F7CXE4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm7535F7CXE4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm7535F7CXE4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm7535F7CXE4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm7535F7CXE4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm7535F7CXE4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm7535F7CXE4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm7535F7CXE4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm7535F7CXE4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm7535F7CXE4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm7535F7CXE4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm7535F7CXE4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm7535F7CXE4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm7535F7CXE4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm7535F7CXE4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm7535F7CXE4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm7535F7CXE4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm7535F7CXE4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm7535F7CXE4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm7535F7CXE4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm7535F7CXE4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm7535F7CXE4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm7535F7CXE4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm7535F7CXE4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm7535F7CXE4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm7535F7CXE4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm7535F7CXE4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm7535F7CXE4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm7535F7CXE4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm7535F7CXE4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm7535F7CXE4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm7535F7CXE4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm7535F7CXE4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm7535F7CXE4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm7535F7CXE4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm7535F7CXE4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm7535F7CXE4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm7535F7CXE4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm7535F7CXE4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm7535F7CXE4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm7535F7CXE4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm7535F7CXE4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm7535F7CXE4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm7535F7CXE4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm7535F7CXE4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm7535F7CXE4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm7535F7CXE4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm7535F7CXE4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm7535F7CXE4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm7535F7CXE4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm7535F7CXE4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm7535F7CXE4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm7535F7CXE4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm7535F7CXE4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm7535F7CXE4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm7535F7CXE4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm7535F7CXE4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm7535F7CXE4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm7535F7CXE4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm7535F7CXE4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm7535F7CXE4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm7535F7CXE4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm7535F7CXE4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm7535F7CXE4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm7535F7CXE4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm7535F7CXE4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm7535F7CXE4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm7535F7CXE4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm7535F7CXE4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm7535F7CXE4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm7535F7CXE4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm7535F7CXE4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm7535F7CXE4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm7535F7CXE4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms