Protein–RNA interactions for Protein: F7AXK2

Gm8871, Predicted pseudogene 8871 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8871F7AXK2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8871F7AXK2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8871F7AXK2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm8871F7AXK2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm8871F7AXK2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8871F7AXK2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm8871F7AXK2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm8871F7AXK2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm8871F7AXK2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8871F7AXK2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm8871F7AXK2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm8871F7AXK2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8871F7AXK2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm8871F7AXK2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm8871F7AXK2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8871F7AXK2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm8871F7AXK2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8871F7AXK2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8871F7AXK2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm8871F7AXK2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8871F7AXK2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm8871F7AXK2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm8871F7AXK2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm8871F7AXK2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm8871F7AXK2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8871F7AXK2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm8871F7AXK2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8871F7AXK2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm8871F7AXK2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm8871F7AXK2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm8871F7AXK2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8871F7AXK2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8871F7AXK2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm8871F7AXK2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8871F7AXK2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm8871F7AXK2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8871F7AXK2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8871F7AXK2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm8871F7AXK2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm8871F7AXK2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8871F7AXK2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8871F7AXK2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8871F7AXK2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm8871F7AXK2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8871F7AXK2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8871F7AXK2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm8871F7AXK2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gm8871F7AXK2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm8871F7AXK2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm8871F7AXK2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8871F7AXK2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8871F7AXK2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm8871F7AXK2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm8871F7AXK2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm8871F7AXK2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm8871F7AXK2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm8871F7AXK2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8871F7AXK2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8871F7AXK2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8871F7AXK2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8871F7AXK2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm8871F7AXK2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm8871F7AXK2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm8871F7AXK2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm8871F7AXK2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm8871F7AXK2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8871F7AXK2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm8871F7AXK2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8871F7AXK2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm8871F7AXK2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm8871F7AXK2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm8871F7AXK2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm8871F7AXK2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm8871F7AXK2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8871F7AXK2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8871F7AXK2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8871F7AXK2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8871F7AXK2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8871F7AXK2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8871F7AXK2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8871F7AXK2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8871F7AXK2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm8871F7AXK2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8871F7AXK2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8871F7AXK2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8871F7AXK2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8871F7AXK2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8871F7AXK2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8871F7AXK2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8871F7AXK2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8871F7AXK2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8871F7AXK2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8871F7AXK2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8871F7AXK2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8871F7AXK2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8871F7AXK2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8871F7AXK2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8871F7AXK2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8871F7AXK2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8871F7AXK2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms