Protein–RNA interactions for Protein: F6VUT6

Gm8251, Predicted gene 8251, mousemouse

Predictions only

Length 1,994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8251F6VUT6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm8251F6VUT6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm8251F6VUT6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm8251F6VUT6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm8251F6VUT6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm8251F6VUT6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm8251F6VUT6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm8251F6VUT6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm8251F6VUT6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm8251F6VUT6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm8251F6VUT6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm8251F6VUT6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm8251F6VUT6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm8251F6VUT6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm8251F6VUT6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm8251F6VUT6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm8251F6VUT6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm8251F6VUT6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm8251F6VUT6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm8251F6VUT6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm8251F6VUT6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm8251F6VUT6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm8251F6VUT6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm8251F6VUT6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm8251F6VUT6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm8251F6VUT6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm8251F6VUT6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm8251F6VUT6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm8251F6VUT6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm8251F6VUT6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm8251F6VUT6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm8251F6VUT6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm8251F6VUT6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm8251F6VUT6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm8251F6VUT6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm8251F6VUT6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm8251F6VUT6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm8251F6VUT6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm8251F6VUT6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm8251F6VUT6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm8251F6VUT6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm8251F6VUT6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm8251F6VUT6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm8251F6VUT6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm8251F6VUT6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm8251F6VUT6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm8251F6VUT6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm8251F6VUT6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm8251F6VUT6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm8251F6VUT6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm8251F6VUT6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm8251F6VUT6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm8251F6VUT6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm8251F6VUT6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm8251F6VUT6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm8251F6VUT6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm8251F6VUT6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm8251F6VUT6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm8251F6VUT6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm8251F6VUT6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm8251F6VUT6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm8251F6VUT6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm8251F6VUT6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm8251F6VUT6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm8251F6VUT6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm8251F6VUT6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm8251F6VUT6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm8251F6VUT6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm8251F6VUT6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8251F6VUT6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8251F6VUT6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm8251F6VUT6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm8251F6VUT6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm8251F6VUT6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm8251F6VUT6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm8251F6VUT6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8251F6VUT6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm8251F6VUT6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm8251F6VUT6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm8251F6VUT6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8251F6VUT6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm8251F6VUT6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm8251F6VUT6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm8251F6VUT6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm8251F6VUT6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8251F6VUT6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8251F6VUT6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8251F6VUT6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm8251F6VUT6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8251F6VUT6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8251F6VUT6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8251F6VUT6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm8251F6VUT6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm8251F6VUT6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm8251F6VUT6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm8251F6VUT6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm8251F6VUT6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm8251F6VUT6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm8251F6VUT6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm8251F6VUT6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms