Protein–RNA interactions for Protein: F6SVV1

Gm9493, 40S ribosomal protein S7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9493F6SVV1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm9493F6SVV1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm9493F6SVV1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm9493F6SVV1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm9493F6SVV1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm9493F6SVV1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm9493F6SVV1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm9493F6SVV1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm9493F6SVV1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm9493F6SVV1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm9493F6SVV1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm9493F6SVV1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm9493F6SVV1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm9493F6SVV1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm9493F6SVV1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm9493F6SVV1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm9493F6SVV1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm9493F6SVV1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm9493F6SVV1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm9493F6SVV1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm9493F6SVV1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm9493F6SVV1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm9493F6SVV1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm9493F6SVV1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm9493F6SVV1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm9493F6SVV1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm9493F6SVV1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm9493F6SVV1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm9493F6SVV1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm9493F6SVV1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm9493F6SVV1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm9493F6SVV1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm9493F6SVV1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm9493F6SVV1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm9493F6SVV1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm9493F6SVV1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm9493F6SVV1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm9493F6SVV1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm9493F6SVV1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm9493F6SVV1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm9493F6SVV1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm9493F6SVV1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm9493F6SVV1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm9493F6SVV1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm9493F6SVV1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm9493F6SVV1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm9493F6SVV1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm9493F6SVV1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm9493F6SVV1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm9493F6SVV1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm9493F6SVV1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm9493F6SVV1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm9493F6SVV1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm9493F6SVV1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm9493F6SVV1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm9493F6SVV1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm9493F6SVV1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm9493F6SVV1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm9493F6SVV1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm9493F6SVV1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm9493F6SVV1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm9493F6SVV1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm9493F6SVV1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm9493F6SVV1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm9493F6SVV1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm9493F6SVV1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm9493F6SVV1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm9493F6SVV1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm9493F6SVV1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm9493F6SVV1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm9493F6SVV1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm9493F6SVV1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm9493F6SVV1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm9493F6SVV1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm9493F6SVV1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm9493F6SVV1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm9493F6SVV1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm9493F6SVV1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm9493F6SVV1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm9493F6SVV1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm9493F6SVV1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm9493F6SVV1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm9493F6SVV1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm9493F6SVV1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm9493F6SVV1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm9493F6SVV1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm9493F6SVV1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm9493F6SVV1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm9493F6SVV1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm9493F6SVV1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm9493F6SVV1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm9493F6SVV1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm9493F6SVV1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm9493F6SVV1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm9493F6SVV1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm9493F6SVV1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm9493F6SVV1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm9493F6SVV1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm9493F6SVV1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm9493F6SVV1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms