Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Taf4E9QAP7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Taf4E9QAP7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Taf4E9QAP7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf4E9QAP7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Taf4E9QAP7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Taf4E9QAP7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Taf4E9QAP7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Taf4E9QAP7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Taf4E9QAP7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Taf4E9QAP7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf4E9QAP7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Taf4E9QAP7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Taf4E9QAP7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Taf4E9QAP7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Taf4E9QAP7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Taf4E9QAP7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Taf4E9QAP7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Taf4E9QAP7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Taf4E9QAP7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Taf4E9QAP7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Taf4E9QAP7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Taf4E9QAP7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Taf4E9QAP7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Taf4E9QAP7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Taf4E9QAP7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Taf4E9QAP7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf4E9QAP7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf4E9QAP7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Taf4E9QAP7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf4E9QAP7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf4E9QAP7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf4E9QAP7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf4E9QAP7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf4E9QAP7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf4E9QAP7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Taf4E9QAP7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf4E9QAP7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Taf4E9QAP7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf4E9QAP7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf4E9QAP7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Taf4E9QAP7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf4E9QAP7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf4E9QAP7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Taf4E9QAP7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Taf4E9QAP7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Taf4E9QAP7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Taf4E9QAP7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf4E9QAP7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf4E9QAP7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Taf4E9QAP7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Taf4E9QAP7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Taf4E9QAP7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Taf4E9QAP7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Taf4E9QAP7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Taf4E9QAP7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Taf4E9QAP7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Taf4E9QAP7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Taf4E9QAP7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Taf4E9QAP7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Taf4E9QAP7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Taf4E9QAP7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Taf4E9QAP7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Taf4E9QAP7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Taf4E9QAP7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Taf4E9QAP7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Taf4E9QAP7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Taf4E9QAP7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Taf4E9QAP7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Taf4E9QAP7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Taf4E9QAP7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Taf4E9QAP7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Taf4E9QAP7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Taf4E9QAP7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Taf4E9QAP7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Taf4E9QAP7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Taf4E9QAP7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Taf4E9QAP7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Taf4E9QAP7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Taf4E9QAP7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Taf4E9QAP7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Taf4E9QAP7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Taf4E9QAP7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Taf4E9QAP7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Taf4E9QAP7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Taf4E9QAP7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Taf4E9QAP7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Taf4E9QAP7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Taf4E9QAP7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Taf4E9QAP7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Taf4E9QAP7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Taf4E9QAP7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Taf4E9QAP7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Taf4E9QAP7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Taf4E9QAP7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Taf4E9QAP7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Taf4E9QAP7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Taf4E9QAP7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Taf4E9QAP7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Taf4E9QAP7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms