Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Pik3c2bE9QAN8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Pik3c2bE9QAN8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Pik3c2bE9QAN8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Pik3c2bE9QAN8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Pik3c2bE9QAN8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Pik3c2bE9QAN8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Pik3c2bE9QAN8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Pik3c2bE9QAN8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Pik3c2bE9QAN8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Pik3c2bE9QAN8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Pik3c2bE9QAN8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Pik3c2bE9QAN8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Pik3c2bE9QAN8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Pik3c2bE9QAN8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Pik3c2bE9QAN8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Pik3c2bE9QAN8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Pik3c2bE9QAN8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Pik3c2bE9QAN8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Pik3c2bE9QAN8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Pik3c2bE9QAN8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pik3c2bE9QAN8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Pik3c2bE9QAN8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Pik3c2bE9QAN8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Pik3c2bE9QAN8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Pik3c2bE9QAN8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Pik3c2bE9QAN8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pik3c2bE9QAN8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pik3c2bE9QAN8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Pik3c2bE9QAN8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Pik3c2bE9QAN8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Pik3c2bE9QAN8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Pik3c2bE9QAN8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pik3c2bE9QAN8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Pik3c2bE9QAN8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Pik3c2bE9QAN8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Pik3c2bE9QAN8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pik3c2bE9QAN8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pik3c2bE9QAN8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Pik3c2bE9QAN8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Pik3c2bE9QAN8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pik3c2bE9QAN8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Pik3c2bE9QAN8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pik3c2bE9QAN8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Pik3c2bE9QAN8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Pik3c2bE9QAN8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Pik3c2bE9QAN8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
Pik3c2bE9QAN8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pik3c2bE9QAN8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pik3c2bE9QAN8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Pik3c2bE9QAN8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pik3c2bE9QAN8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pik3c2bE9QAN8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pik3c2bE9QAN8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pik3c2bE9QAN8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pik3c2bE9QAN8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pik3c2bE9QAN8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pik3c2bE9QAN8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pik3c2bE9QAN8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Pik3c2bE9QAN8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pik3c2bE9QAN8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Pik3c2bE9QAN8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Pik3c2bE9QAN8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pik3c2bE9QAN8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pik3c2bE9QAN8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Pik3c2bE9QAN8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Pik3c2bE9QAN8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Pik3c2bE9QAN8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pik3c2bE9QAN8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Pik3c2bE9QAN8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pik3c2bE9QAN8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pik3c2bE9QAN8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pik3c2bE9QAN8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Pik3c2bE9QAN8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Pik3c2bE9QAN8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Pik3c2bE9QAN8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Pik3c2bE9QAN8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pik3c2bE9QAN8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pik3c2bE9QAN8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Pik3c2bE9QAN8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Pik3c2bE9QAN8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Pik3c2bE9QAN8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pik3c2bE9QAN8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Pik3c2bE9QAN8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Pik3c2bE9QAN8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pik3c2bE9QAN8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pik3c2bE9QAN8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pik3c2bE9QAN8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Pik3c2bE9QAN8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Pik3c2bE9QAN8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pik3c2bE9QAN8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Pik3c2bE9QAN8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Pik3c2bE9QAN8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pik3c2bE9QAN8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pik3c2bE9QAN8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pik3c2bE9QAN8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Pik3c2bE9QAN8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Pik3c2bE9QAN8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pik3c2bE9QAN8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pik3c2bE9QAN8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms