Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc7bE9Q9Y3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc7bE9Q9Y3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc7bE9Q9Y3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc7bE9Q9Y3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc7bE9Q9Y3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc7bE9Q9Y3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc7bE9Q9Y3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms