Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Srsf11E9Q6E5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Srsf11E9Q6E5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Srsf11E9Q6E5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Srsf11E9Q6E5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Srsf11E9Q6E5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Srsf11E9Q6E5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Srsf11E9Q6E5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Srsf11E9Q6E5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Srsf11E9Q6E5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Srsf11E9Q6E5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Srsf11E9Q6E5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Srsf11E9Q6E5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Srsf11E9Q6E5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srsf11E9Q6E5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srsf11E9Q6E5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Srsf11E9Q6E5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Srsf11E9Q6E5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Srsf11E9Q6E5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Srsf11E9Q6E5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Srsf11E9Q6E5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srsf11E9Q6E5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Srsf11E9Q6E5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Srsf11E9Q6E5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Srsf11E9Q6E5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Srsf11E9Q6E5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Srsf11E9Q6E5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Srsf11E9Q6E5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Srsf11E9Q6E5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Srsf11E9Q6E5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srsf11E9Q6E5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srsf11E9Q6E5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Srsf11E9Q6E5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Srsf11E9Q6E5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Srsf11E9Q6E5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Srsf11E9Q6E5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Srsf11E9Q6E5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Srsf11E9Q6E5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Srsf11E9Q6E5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Srsf11E9Q6E5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Srsf11E9Q6E5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Srsf11E9Q6E5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Srsf11E9Q6E5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Srsf11E9Q6E5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Srsf11E9Q6E5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Srsf11E9Q6E5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Srsf11E9Q6E5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Srsf11E9Q6E5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Srsf11E9Q6E5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Srsf11E9Q6E5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Srsf11E9Q6E5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Srsf11E9Q6E5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Srsf11E9Q6E5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Srsf11E9Q6E5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Srsf11E9Q6E5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Srsf11E9Q6E5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Srsf11E9Q6E5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Srsf11E9Q6E5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Srsf11E9Q6E5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Srsf11E9Q6E5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Srsf11E9Q6E5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Srsf11E9Q6E5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Srsf11E9Q6E5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Srsf11E9Q6E5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Srsf11E9Q6E5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Srsf11E9Q6E5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Srsf11E9Q6E5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Srsf11E9Q6E5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Srsf11E9Q6E5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Srsf11E9Q6E5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Srsf11E9Q6E5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Srsf11E9Q6E5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Srsf11E9Q6E5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Srsf11E9Q6E5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Srsf11E9Q6E5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Srsf11E9Q6E5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Srsf11E9Q6E5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Srsf11E9Q6E5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Srsf11E9Q6E5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Srsf11E9Q6E5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Srsf11E9Q6E5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Srsf11E9Q6E5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Srsf11E9Q6E5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Srsf11E9Q6E5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Srsf11E9Q6E5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Srsf11E9Q6E5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Srsf11E9Q6E5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Srsf11E9Q6E5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Srsf11E9Q6E5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Srsf11E9Q6E5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Srsf11E9Q6E5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Srsf11E9Q6E5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Srsf11E9Q6E5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Srsf11E9Q6E5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Srsf11E9Q6E5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Srsf11E9Q6E5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Srsf11E9Q6E5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Srsf11E9Q6E5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Srsf11E9Q6E5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms