Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4P1

Wdfy1, WD repeat and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdfy1E9Q4P1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Wdfy1E9Q4P1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Wdfy1E9Q4P1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Wdfy1E9Q4P1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Wdfy1E9Q4P1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Wdfy1E9Q4P1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Wdfy1E9Q4P1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Wdfy1E9Q4P1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Wdfy1E9Q4P1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Wdfy1E9Q4P1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Wdfy1E9Q4P1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdfy1E9Q4P1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdfy1E9Q4P1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Wdfy1E9Q4P1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Wdfy1E9Q4P1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Wdfy1E9Q4P1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Wdfy1E9Q4P1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Wdfy1E9Q4P1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Wdfy1E9Q4P1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Wdfy1E9Q4P1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Wdfy1E9Q4P1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wdfy1E9Q4P1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Wdfy1E9Q4P1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Wdfy1E9Q4P1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Wdfy1E9Q4P1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Wdfy1E9Q4P1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Wdfy1E9Q4P1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdfy1E9Q4P1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdfy1E9Q4P1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdfy1E9Q4P1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Wdfy1E9Q4P1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Wdfy1E9Q4P1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdfy1E9Q4P1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdfy1E9Q4P1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wdfy1E9Q4P1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wdfy1E9Q4P1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wdfy1E9Q4P1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdfy1E9Q4P1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Wdfy1E9Q4P1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Wdfy1E9Q4P1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Wdfy1E9Q4P1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdfy1E9Q4P1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdfy1E9Q4P1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdfy1E9Q4P1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdfy1E9Q4P1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdfy1E9Q4P1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdfy1E9Q4P1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Wdfy1E9Q4P1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdfy1E9Q4P1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Wdfy1E9Q4P1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wdfy1E9Q4P1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Wdfy1E9Q4P1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Wdfy1E9Q4P1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Wdfy1E9Q4P1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdfy1E9Q4P1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdfy1E9Q4P1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdfy1E9Q4P1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdfy1E9Q4P1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdfy1E9Q4P1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdfy1E9Q4P1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdfy1E9Q4P1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdfy1E9Q4P1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdfy1E9Q4P1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdfy1E9Q4P1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdfy1E9Q4P1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdfy1E9Q4P1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdfy1E9Q4P1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdfy1E9Q4P1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdfy1E9Q4P1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdfy1E9Q4P1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdfy1E9Q4P1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdfy1E9Q4P1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdfy1E9Q4P1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdfy1E9Q4P1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Wdfy1E9Q4P1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdfy1E9Q4P1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdfy1E9Q4P1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdfy1E9Q4P1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdfy1E9Q4P1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdfy1E9Q4P1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdfy1E9Q4P1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdfy1E9Q4P1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdfy1E9Q4P1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdfy1E9Q4P1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms