Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ryr1E9PZQ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ryr1E9PZQ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ryr1E9PZQ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ryr1E9PZQ0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ryr1E9PZQ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ryr1E9PZQ0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ryr1E9PZQ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ryr1E9PZQ0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ryr1E9PZQ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ryr1E9PZQ0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ryr1E9PZQ0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ryr1E9PZQ0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ryr1E9PZQ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ryr1E9PZQ0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ryr1E9PZQ0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ryr1E9PZQ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ryr1E9PZQ0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ryr1E9PZQ0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ryr1E9PZQ0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ryr1E9PZQ0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ryr1E9PZQ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ryr1E9PZQ0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ryr1E9PZQ0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ryr1E9PZQ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ryr1E9PZQ0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ryr1E9PZQ0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ryr1E9PZQ0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ryr1E9PZQ0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ryr1E9PZQ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ryr1E9PZQ0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ryr1E9PZQ0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ryr1E9PZQ0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ryr1E9PZQ0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ryr1E9PZQ0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ryr1E9PZQ0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ryr1E9PZQ0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ryr1E9PZQ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ryr1E9PZQ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ryr1E9PZQ0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ryr1E9PZQ0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ryr1E9PZQ0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ryr1E9PZQ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ryr1E9PZQ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ryr1E9PZQ0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ryr1E9PZQ0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ryr1E9PZQ0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ryr1E9PZQ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ryr1E9PZQ0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ryr1E9PZQ0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ryr1E9PZQ0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ryr1E9PZQ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ryr1E9PZQ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ryr1E9PZQ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ryr1E9PZQ0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ryr1E9PZQ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ryr1E9PZQ0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ryr1E9PZQ0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ryr1E9PZQ0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ryr1E9PZQ0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ryr1E9PZQ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ryr1E9PZQ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ryr1E9PZQ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ryr1E9PZQ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ryr1E9PZQ0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ryr1E9PZQ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ryr1E9PZQ0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ryr1E9PZQ0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ryr1E9PZQ0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ryr1E9PZQ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ryr1E9PZQ0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ryr1E9PZQ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ryr1E9PZQ0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ryr1E9PZQ0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ryr1E9PZQ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ryr1E9PZQ0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ryr1E9PZQ0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ryr1E9PZQ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ryr1E9PZQ0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ryr1E9PZQ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ryr1E9PZQ0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ryr1E9PZQ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ryr1E9PZQ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ryr1E9PZQ0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ryr1E9PZQ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ryr1E9PZQ0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ryr1E9PZQ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ryr1E9PZQ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ryr1E9PZQ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ryr1E9PZQ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ryr1E9PZQ0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ryr1E9PZQ0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ryr1E9PZQ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ryr1E9PZQ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.9 ms