Protein–RNA interactions for Protein: E9PYJ0

Tcp10b, T-complex protein 10b, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp10bE9PYJ0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tcp10bE9PYJ0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tcp10bE9PYJ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tcp10bE9PYJ0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tcp10bE9PYJ0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tcp10bE9PYJ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tcp10bE9PYJ0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tcp10bE9PYJ0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tcp10bE9PYJ0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tcp10bE9PYJ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tcp10bE9PYJ0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tcp10bE9PYJ0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tcp10bE9PYJ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tcp10bE9PYJ0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tcp10bE9PYJ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tcp10bE9PYJ0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tcp10bE9PYJ0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tcp10bE9PYJ0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tcp10bE9PYJ0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tcp10bE9PYJ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tcp10bE9PYJ0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tcp10bE9PYJ0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tcp10bE9PYJ0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcp10bE9PYJ0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcp10bE9PYJ0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcp10bE9PYJ0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcp10bE9PYJ0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcp10bE9PYJ0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcp10bE9PYJ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcp10bE9PYJ0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcp10bE9PYJ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tcp10bE9PYJ0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tcp10bE9PYJ0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tcp10bE9PYJ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcp10bE9PYJ0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcp10bE9PYJ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tcp10bE9PYJ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tcp10bE9PYJ0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcp10bE9PYJ0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcp10bE9PYJ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcp10bE9PYJ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcp10bE9PYJ0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcp10bE9PYJ0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tcp10bE9PYJ0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Tcp10bE9PYJ0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tcp10bE9PYJ0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tcp10bE9PYJ0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tcp10bE9PYJ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tcp10bE9PYJ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tcp10bE9PYJ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tcp10bE9PYJ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tcp10bE9PYJ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tcp10bE9PYJ0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tcp10bE9PYJ0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Tcp10bE9PYJ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tcp10bE9PYJ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tcp10bE9PYJ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tcp10bE9PYJ0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tcp10bE9PYJ0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tcp10bE9PYJ0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tcp10bE9PYJ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tcp10bE9PYJ0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tcp10bE9PYJ0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tcp10bE9PYJ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tcp10bE9PYJ0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tcp10bE9PYJ0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tcp10bE9PYJ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tcp10bE9PYJ0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tcp10bE9PYJ0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tcp10bE9PYJ0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tcp10bE9PYJ0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tcp10bE9PYJ0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tcp10bE9PYJ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tcp10bE9PYJ0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tcp10bE9PYJ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tcp10bE9PYJ0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tcp10bE9PYJ0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tcp10bE9PYJ0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tcp10bE9PYJ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tcp10bE9PYJ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tcp10bE9PYJ0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tcp10bE9PYJ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcp10bE9PYJ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcp10bE9PYJ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcp10bE9PYJ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcp10bE9PYJ0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcp10bE9PYJ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tcp10bE9PYJ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tcp10bE9PYJ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tcp10bE9PYJ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tcp10bE9PYJ0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tcp10bE9PYJ0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcp10bE9PYJ0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcp10bE9PYJ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcp10bE9PYJ0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcp10bE9PYJ0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcp10bE9PYJ0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Tcp10bE9PYJ0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tcp10bE9PYJ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tcp10bE9PYJ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms