Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm3298E9PW80 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3298E9PW80 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3298E9PW80 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm3298E9PW80 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3298E9PW80 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3298E9PW80 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3298E9PW80 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3298E9PW80 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3298E9PW80 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3298E9PW80 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3298E9PW80 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3298E9PW80 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3298E9PW80 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3298E9PW80 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3298E9PW80 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3298E9PW80 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3298E9PW80 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm3298E9PW80 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm3298E9PW80 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3298E9PW80 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3298E9PW80 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3298E9PW80 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm3298E9PW80 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm3298E9PW80 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3298E9PW80 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3298E9PW80 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3298E9PW80 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3298E9PW80 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3298E9PW80 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3298E9PW80 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm3298E9PW80 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm3298E9PW80 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3298E9PW80 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm3298E9PW80 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm3298E9PW80 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm3298E9PW80 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm3298E9PW80 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3298E9PW80 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm3298E9PW80 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3298E9PW80 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm3298E9PW80 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3298E9PW80 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3298E9PW80 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm3298E9PW80 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3298E9PW80 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3298E9PW80 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3298E9PW80 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3298E9PW80 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3298E9PW80 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3298E9PW80 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3298E9PW80 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3298E9PW80 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3298E9PW80 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3298E9PW80 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3298E9PW80 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3298E9PW80 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3298E9PW80 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3298E9PW80 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3298E9PW80 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3298E9PW80 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3298E9PW80 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3298E9PW80 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3298E9PW80 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3298E9PW80 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3298E9PW80 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3298E9PW80 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3298E9PW80 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3298E9PW80 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3298E9PW80 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3298E9PW80 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3298E9PW80 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3298E9PW80 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3298E9PW80 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3298E9PW80 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3298E9PW80 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3298E9PW80 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3298E9PW80 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3298E9PW80 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3298E9PW80 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3298E9PW80 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3298E9PW80 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3298E9PW80 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3298E9PW80 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm3298E9PW80 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
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