Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc62E9PVD1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc62E9PVD1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc62E9PVD1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc62E9PVD1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc62E9PVD1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc62E9PVD1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc62E9PVD1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc62E9PVD1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc62E9PVD1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc62E9PVD1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc62E9PVD1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc62E9PVD1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc62E9PVD1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc62E9PVD1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc62E9PVD1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc62E9PVD1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc62E9PVD1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc62E9PVD1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc62E9PVD1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc62E9PVD1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc62E9PVD1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc62E9PVD1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc62E9PVD1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc62E9PVD1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc62E9PVD1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc62E9PVD1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc62E9PVD1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc62E9PVD1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc62E9PVD1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc62E9PVD1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc62E9PVD1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc62E9PVD1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc62E9PVD1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc62E9PVD1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc62E9PVD1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc62E9PVD1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc62E9PVD1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc62E9PVD1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc62E9PVD1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc62E9PVD1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc62E9PVD1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc62E9PVD1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc62E9PVD1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc62E9PVD1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc62E9PVD1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc62E9PVD1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc62E9PVD1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc62E9PVD1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc62E9PVD1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc62E9PVD1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc62E9PVD1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc62E9PVD1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc62E9PVD1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc62E9PVD1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc62E9PVD1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc62E9PVD1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc62E9PVD1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc62E9PVD1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc62E9PVD1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc62E9PVD1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc62E9PVD1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc62E9PVD1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc62E9PVD1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc62E9PVD1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc62E9PVD1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc62E9PVD1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc62E9PVD1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc62E9PVD1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc62E9PVD1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc62E9PVD1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc62E9PVD1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc62E9PVD1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc62E9PVD1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc62E9PVD1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc62E9PVD1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc62E9PVD1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc62E9PVD1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc62E9PVD1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc62E9PVD1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc62E9PVD1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms