Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp839E9PUU5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfp839E9PUU5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp839E9PUU5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp839E9PUU5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zfp839E9PUU5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Zfp839E9PUU5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfp839E9PUU5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfp839E9PUU5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Zfp839E9PUU5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp839E9PUU5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp839E9PUU5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfp839E9PUU5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zfp839E9PUU5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zfp839E9PUU5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zfp839E9PUU5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zfp839E9PUU5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Zfp839E9PUU5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfp839E9PUU5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfp839E9PUU5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Zfp839E9PUU5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfp839E9PUU5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zfp839E9PUU5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zfp839E9PUU5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfp839E9PUU5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp839E9PUU5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp839E9PUU5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp839E9PUU5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp839E9PUU5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp839E9PUU5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp839E9PUU5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfp839E9PUU5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfp839E9PUU5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfp839E9PUU5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Zfp839E9PUU5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Zfp839E9PUU5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zfp839E9PUU5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfp839E9PUU5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfp839E9PUU5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zfp839E9PUU5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Zfp839E9PUU5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zfp839E9PUU5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zfp839E9PUU5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zfp839E9PUU5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zfp839E9PUU5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfp839E9PUU5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfp839E9PUU5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfp839E9PUU5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfp839E9PUU5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zfp839E9PUU5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Zfp839E9PUU5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zfp839E9PUU5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zfp839E9PUU5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zfp839E9PUU5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zfp839E9PUU5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Zfp839E9PUU5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfp839E9PUU5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfp839E9PUU5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfp839E9PUU5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfp839E9PUU5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp839E9PUU5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfp839E9PUU5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfp839E9PUU5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfp839E9PUU5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfp839E9PUU5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfp839E9PUU5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfp839E9PUU5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfp839E9PUU5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zfp839E9PUU5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zfp839E9PUU5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zfp839E9PUU5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfp839E9PUU5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfp839E9PUU5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp839E9PUU5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfp839E9PUU5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Zfp839E9PUU5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zfp839E9PUU5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zfp839E9PUU5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zfp839E9PUU5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfp839E9PUU5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfp839E9PUU5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfp839E9PUU5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfp839E9PUU5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfp839E9PUU5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfp839E9PUU5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfp839E9PUU5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zfp839E9PUU5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zfp839E9PUU5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp839E9PUU5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp839E9PUU5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfp839E9PUU5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfp839E9PUU5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfp839E9PUU5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zfp839E9PUU5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zfp839E9PUU5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp839E9PUU5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp839E9PUU5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zfp839E9PUU5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp839E9PUU5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp839E9PUU5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms