Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Syde2E9PUP1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Syde2E9PUP1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Syde2E9PUP1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Syde2E9PUP1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Syde2E9PUP1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Syde2E9PUP1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Syde2E9PUP1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Syde2E9PUP1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Syde2E9PUP1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Syde2E9PUP1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Syde2E9PUP1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Syde2E9PUP1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Syde2E9PUP1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Syde2E9PUP1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Syde2E9PUP1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Syde2E9PUP1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Syde2E9PUP1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Syde2E9PUP1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Syde2E9PUP1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Syde2E9PUP1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Syde2E9PUP1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Syde2E9PUP1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Syde2E9PUP1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Syde2E9PUP1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Syde2E9PUP1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Syde2E9PUP1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Syde2E9PUP1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Syde2E9PUP1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Syde2E9PUP1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Syde2E9PUP1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Syde2E9PUP1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Syde2E9PUP1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Syde2E9PUP1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Syde2E9PUP1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Syde2E9PUP1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Syde2E9PUP1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Syde2E9PUP1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Syde2E9PUP1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Syde2E9PUP1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Syde2E9PUP1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Syde2E9PUP1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Syde2E9PUP1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Syde2E9PUP1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Syde2E9PUP1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Syde2E9PUP1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Syde2E9PUP1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Syde2E9PUP1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
Syde2E9PUP1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Syde2E9PUP1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Syde2E9PUP1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Syde2E9PUP1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Syde2E9PUP1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Syde2E9PUP1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Syde2E9PUP1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Syde2E9PUP1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Syde2E9PUP1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Syde2E9PUP1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Syde2E9PUP1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Syde2E9PUP1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Syde2E9PUP1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Syde2E9PUP1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Syde2E9PUP1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Syde2E9PUP1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Syde2E9PUP1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Syde2E9PUP1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Syde2E9PUP1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Syde2E9PUP1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Syde2E9PUP1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Syde2E9PUP1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Syde2E9PUP1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Syde2E9PUP1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Syde2E9PUP1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Syde2E9PUP1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Syde2E9PUP1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Syde2E9PUP1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Syde2E9PUP1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Syde2E9PUP1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Syde2E9PUP1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Syde2E9PUP1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Syde2E9PUP1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Syde2E9PUP1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Syde2E9PUP1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Syde2E9PUP1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Syde2E9PUP1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Syde2E9PUP1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Syde2E9PUP1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Syde2E9PUP1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Syde2E9PUP1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Syde2E9PUP1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Syde2E9PUP1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Syde2E9PUP1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Syde2E9PUP1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Syde2E9PUP1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Syde2E9PUP1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Syde2E9PUP1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Syde2E9PUP1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Syde2E9PUP1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Syde2E9PUP1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Syde2E9PUP1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms