Protein–RNA interactions for Protein: D3Z536

Gm8225, Predicted gene 8225, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8225D3Z536 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8225D3Z536 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8225D3Z536 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8225D3Z536 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8225D3Z536 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8225D3Z536 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8225D3Z536 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8225D3Z536 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8225D3Z536 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8225D3Z536 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8225D3Z536 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8225D3Z536 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8225D3Z536 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8225D3Z536 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8225D3Z536 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8225D3Z536 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8225D3Z536 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8225D3Z536 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8225D3Z536 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8225D3Z536 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8225D3Z536 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8225D3Z536 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8225D3Z536 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8225D3Z536 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8225D3Z536 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8225D3Z536 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8225D3Z536 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8225D3Z536 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8225D3Z536 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8225D3Z536 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8225D3Z536 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8225D3Z536 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm8225D3Z536 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8225D3Z536 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8225D3Z536 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8225D3Z536 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8225D3Z536 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8225D3Z536 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8225D3Z536 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8225D3Z536 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8225D3Z536 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm8225D3Z536 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm8225D3Z536 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8225D3Z536 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8225D3Z536 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8225D3Z536 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8225D3Z536 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8225D3Z536 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8225D3Z536 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8225D3Z536 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8225D3Z536 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8225D3Z536 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8225D3Z536 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8225D3Z536 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8225D3Z536 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8225D3Z536 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8225D3Z536 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8225D3Z536 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8225D3Z536 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8225D3Z536 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8225D3Z536 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8225D3Z536 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8225D3Z536 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8225D3Z536 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8225D3Z536 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8225D3Z536 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8225D3Z536 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8225D3Z536 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8225D3Z536 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8225D3Z536 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8225D3Z536 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8225D3Z536 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8225D3Z536 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8225D3Z536 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8225D3Z536 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8225D3Z536 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8225D3Z536 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8225D3Z536 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8225D3Z536 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm8225D3Z536 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm8225D3Z536 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8225D3Z536 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8225D3Z536 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8225D3Z536 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8225D3Z536 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8225D3Z536 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8225D3Z536 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8225D3Z536 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8225D3Z536 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8225D3Z536 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8225D3Z536 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8225D3Z536 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8225D3Z536 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8225D3Z536 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8225D3Z536 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8225D3Z536 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8225D3Z536 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8225D3Z536 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8225D3Z536 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8225D3Z536 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms