Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms