Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930467E23RikD3Z1P8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930467E23RikD3Z1P8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
4930467E23RikD3Z1P8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930467E23RikD3Z1P8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930467E23RikD3Z1P8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4930467E23RikD3Z1P8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930467E23RikD3Z1P8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930467E23RikD3Z1P8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930467E23RikD3Z1P8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930467E23RikD3Z1P8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930467E23RikD3Z1P8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930467E23RikD3Z1P8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930467E23RikD3Z1P8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
4930467E23RikD3Z1P8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
4930467E23RikD3Z1P8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930467E23RikD3Z1P8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930467E23RikD3Z1P8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930467E23RikD3Z1P8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930467E23RikD3Z1P8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930467E23RikD3Z1P8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930467E23RikD3Z1P8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930467E23RikD3Z1P8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930467E23RikD3Z1P8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930467E23RikD3Z1P8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930467E23RikD3Z1P8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930467E23RikD3Z1P8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930467E23RikD3Z1P8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930467E23RikD3Z1P8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930467E23RikD3Z1P8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930467E23RikD3Z1P8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930467E23RikD3Z1P8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930467E23RikD3Z1P8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930467E23RikD3Z1P8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930467E23RikD3Z1P8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930467E23RikD3Z1P8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930467E23RikD3Z1P8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930467E23RikD3Z1P8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930467E23RikD3Z1P8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930467E23RikD3Z1P8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930467E23RikD3Z1P8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4930467E23RikD3Z1P8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930467E23RikD3Z1P8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930467E23RikD3Z1P8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930467E23RikD3Z1P8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930467E23RikD3Z1P8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930467E23RikD3Z1P8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
4930467E23RikD3Z1P8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
4930467E23RikD3Z1P8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930467E23RikD3Z1P8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930467E23RikD3Z1P8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930467E23RikD3Z1P8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930467E23RikD3Z1P8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930467E23RikD3Z1P8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
4930467E23RikD3Z1P8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930467E23RikD3Z1P8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930467E23RikD3Z1P8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930467E23RikD3Z1P8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930467E23RikD3Z1P8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930467E23RikD3Z1P8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4930467E23RikD3Z1P8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930467E23RikD3Z1P8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930467E23RikD3Z1P8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930467E23RikD3Z1P8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930467E23RikD3Z1P8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930467E23RikD3Z1P8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930467E23RikD3Z1P8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930467E23RikD3Z1P8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930467E23RikD3Z1P8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930467E23RikD3Z1P8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930467E23RikD3Z1P8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930467E23RikD3Z1P8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930467E23RikD3Z1P8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930467E23RikD3Z1P8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930467E23RikD3Z1P8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930467E23RikD3Z1P8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930467E23RikD3Z1P8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930467E23RikD3Z1P8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms