Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf217D3YYI7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf217D3YYI7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf217D3YYI7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf217D3YYI7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf217D3YYI7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf217D3YYI7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf217D3YYI7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf217D3YYI7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf217D3YYI7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf217D3YYI7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf217D3YYI7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf217D3YYI7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf217D3YYI7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf217D3YYI7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf217D3YYI7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf217D3YYI7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf217D3YYI7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf217D3YYI7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf217D3YYI7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf217D3YYI7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf217D3YYI7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf217D3YYI7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf217D3YYI7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf217D3YYI7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf217D3YYI7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf217D3YYI7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf217D3YYI7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf217D3YYI7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf217D3YYI7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf217D3YYI7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf217D3YYI7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf217D3YYI7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf217D3YYI7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf217D3YYI7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf217D3YYI7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf217D3YYI7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf217D3YYI7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf217D3YYI7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf217D3YYI7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf217D3YYI7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf217D3YYI7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf217D3YYI7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf217D3YYI7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf217D3YYI7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf217D3YYI7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf217D3YYI7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf217D3YYI7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf217D3YYI7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf217D3YYI7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf217D3YYI7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf217D3YYI7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf217D3YYI7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf217D3YYI7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf217D3YYI7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf217D3YYI7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf217D3YYI7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf217D3YYI7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf217D3YYI7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf217D3YYI7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf217D3YYI7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf217D3YYI7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf217D3YYI7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf217D3YYI7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf217D3YYI7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf217D3YYI7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf217D3YYI7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf217D3YYI7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf217D3YYI7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf217D3YYI7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf217D3YYI7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf217D3YYI7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf217D3YYI7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf217D3YYI7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf217D3YYI7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf217D3YYI7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf217D3YYI7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf217D3YYI7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf217D3YYI7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf217D3YYI7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf217D3YYI7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf217D3YYI7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf217D3YYI7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf217D3YYI7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf217D3YYI7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf217D3YYI7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf217D3YYI7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf217D3YYI7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf217D3YYI7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf217D3YYI7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf217D3YYI7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf217D3YYI7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf217D3YYI7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf217D3YYI7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf217D3YYI7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf217D3YYI7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf217D3YYI7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf217D3YYI7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf217D3YYI7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf217D3YYI7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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