Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kif28pD3YXS5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kif28pD3YXS5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Kif28pD3YXS5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Kif28pD3YXS5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kif28pD3YXS5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kif28pD3YXS5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kif28pD3YXS5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kif28pD3YXS5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kif28pD3YXS5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Kif28pD3YXS5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kif28pD3YXS5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif28pD3YXS5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif28pD3YXS5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kif28pD3YXS5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kif28pD3YXS5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kif28pD3YXS5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kif28pD3YXS5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif28pD3YXS5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif28pD3YXS5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif28pD3YXS5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kif28pD3YXS5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif28pD3YXS5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kif28pD3YXS5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kif28pD3YXS5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kif28pD3YXS5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kif28pD3YXS5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif28pD3YXS5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kif28pD3YXS5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif28pD3YXS5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kif28pD3YXS5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif28pD3YXS5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kif28pD3YXS5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kif28pD3YXS5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kif28pD3YXS5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kif28pD3YXS5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kif28pD3YXS5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kif28pD3YXS5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif28pD3YXS5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kif28pD3YXS5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Kif28pD3YXS5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kif28pD3YXS5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kif28pD3YXS5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kif28pD3YXS5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Kif28pD3YXS5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kif28pD3YXS5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kif28pD3YXS5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif28pD3YXS5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif28pD3YXS5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kif28pD3YXS5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kif28pD3YXS5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif28pD3YXS5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif28pD3YXS5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kif28pD3YXS5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif28pD3YXS5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kif28pD3YXS5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kif28pD3YXS5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif28pD3YXS5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kif28pD3YXS5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kif28pD3YXS5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif28pD3YXS5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif28pD3YXS5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif28pD3YXS5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kif28pD3YXS5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif28pD3YXS5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif28pD3YXS5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif28pD3YXS5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif28pD3YXS5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kif28pD3YXS5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kif28pD3YXS5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kif28pD3YXS5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif28pD3YXS5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif28pD3YXS5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kif28pD3YXS5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif28pD3YXS5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif28pD3YXS5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif28pD3YXS5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif28pD3YXS5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kif28pD3YXS5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kif28pD3YXS5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kif28pD3YXS5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kif28pD3YXS5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kif28pD3YXS5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kif28pD3YXS5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kif28pD3YXS5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kif28pD3YXS5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kif28pD3YXS5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif28pD3YXS5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kif28pD3YXS5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kif28pD3YXS5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kif28pD3YXS5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kif28pD3YXS5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms