Protein–RNA interactions for Protein: D3YUG0

Samd13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd13D3YUG0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd13D3YUG0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd13D3YUG0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd13D3YUG0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd13D3YUG0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd13D3YUG0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Samd13D3YUG0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd13D3YUG0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd13D3YUG0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd13D3YUG0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd13D3YUG0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd13D3YUG0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd13D3YUG0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd13D3YUG0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd13D3YUG0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd13D3YUG0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd13D3YUG0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd13D3YUG0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd13D3YUG0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd13D3YUG0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd13D3YUG0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd13D3YUG0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Samd13D3YUG0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd13D3YUG0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Samd13D3YUG0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd13D3YUG0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd13D3YUG0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd13D3YUG0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd13D3YUG0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd13D3YUG0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd13D3YUG0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd13D3YUG0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd13D3YUG0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd13D3YUG0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd13D3YUG0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd13D3YUG0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd13D3YUG0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd13D3YUG0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd13D3YUG0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd13D3YUG0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd13D3YUG0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd13D3YUG0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd13D3YUG0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd13D3YUG0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd13D3YUG0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd13D3YUG0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd13D3YUG0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd13D3YUG0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd13D3YUG0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd13D3YUG0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd13D3YUG0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd13D3YUG0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd13D3YUG0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd13D3YUG0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd13D3YUG0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd13D3YUG0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd13D3YUG0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd13D3YUG0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd13D3YUG0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd13D3YUG0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd13D3YUG0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd13D3YUG0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms