Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gabrr3B2RXA8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gabrr3B2RXA8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gabrr3B2RXA8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gabrr3B2RXA8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gabrr3B2RXA8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gabrr3B2RXA8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabrr3B2RXA8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gabrr3B2RXA8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gabrr3B2RXA8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gabrr3B2RXA8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gabrr3B2RXA8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gabrr3B2RXA8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gabrr3B2RXA8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gabrr3B2RXA8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gabrr3B2RXA8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gabrr3B2RXA8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gabrr3B2RXA8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gabrr3B2RXA8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gabrr3B2RXA8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gabrr3B2RXA8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gabrr3B2RXA8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gabrr3B2RXA8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gabrr3B2RXA8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gabrr3B2RXA8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gabrr3B2RXA8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gabrr3B2RXA8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gabrr3B2RXA8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gabrr3B2RXA8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gabrr3B2RXA8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gabrr3B2RXA8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gabrr3B2RXA8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabrr3B2RXA8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabrr3B2RXA8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gabrr3B2RXA8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gabrr3B2RXA8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gabrr3B2RXA8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gabrr3B2RXA8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gabrr3B2RXA8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gabrr3B2RXA8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabrr3B2RXA8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gabrr3B2RXA8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gabrr3B2RXA8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gabrr3B2RXA8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabrr3B2RXA8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gabrr3B2RXA8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gabrr3B2RXA8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gabrr3B2RXA8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabrr3B2RXA8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabrr3B2RXA8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabrr3B2RXA8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabrr3B2RXA8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gabrr3B2RXA8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabrr3B2RXA8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gabrr3B2RXA8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabrr3B2RXA8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabrr3B2RXA8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabrr3B2RXA8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabrr3B2RXA8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabrr3B2RXA8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabrr3B2RXA8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabrr3B2RXA8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabrr3B2RXA8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gabrr3B2RXA8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabrr3B2RXA8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabrr3B2RXA8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabrr3B2RXA8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabrr3B2RXA8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabrr3B2RXA8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabrr3B2RXA8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabrr3B2RXA8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabrr3B2RXA8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabrr3B2RXA8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabrr3B2RXA8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabrr3B2RXA8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabrr3B2RXA8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabrr3B2RXA8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gabrr3B2RXA8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabrr3B2RXA8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabrr3B2RXA8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabrr3B2RXA8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabrr3B2RXA8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabrr3B2RXA8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabrr3B2RXA8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabrr3B2RXA8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabrr3B2RXA8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabrr3B2RXA8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabrr3B2RXA8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabrr3B2RXA8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabrr3B2RXA8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabrr3B2RXA8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabrr3B2RXA8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabrr3B2RXA8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabrr3B2RXA8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabrr3B2RXA8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabrr3B2RXA8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabrr3B2RXA8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabrr3B2RXA8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gabrr3B2RXA8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabrr3B2RXA8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms