Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prrt4B2RU40 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrt4B2RU40 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prrt4B2RU40 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prrt4B2RU40 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prrt4B2RU40 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prrt4B2RU40 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prrt4B2RU40 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prrt4B2RU40 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prrt4B2RU40 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prrt4B2RU40 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prrt4B2RU40 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prrt4B2RU40 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prrt4B2RU40 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prrt4B2RU40 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prrt4B2RU40 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prrt4B2RU40 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrt4B2RU40 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrt4B2RU40 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prrt4B2RU40 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prrt4B2RU40 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prrt4B2RU40 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrt4B2RU40 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrt4B2RU40 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrt4B2RU40 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prrt4B2RU40 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrt4B2RU40 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrt4B2RU40 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrt4B2RU40 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrt4B2RU40 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prrt4B2RU40 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrt4B2RU40 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrt4B2RU40 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrt4B2RU40 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrt4B2RU40 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prrt4B2RU40 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prrt4B2RU40 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prrt4B2RU40 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrt4B2RU40 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrt4B2RU40 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrt4B2RU40 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrt4B2RU40 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrt4B2RU40 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrt4B2RU40 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prrt4B2RU40 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrt4B2RU40 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prrt4B2RU40 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prrt4B2RU40 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prrt4B2RU40 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prrt4B2RU40 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prrt4B2RU40 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prrt4B2RU40 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prrt4B2RU40 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prrt4B2RU40 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prrt4B2RU40 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prrt4B2RU40 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prrt4B2RU40 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prrt4B2RU40 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrt4B2RU40 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrt4B2RU40 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrt4B2RU40 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrt4B2RU40 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrt4B2RU40 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrt4B2RU40 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrt4B2RU40 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prrt4B2RU40 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prrt4B2RU40 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prrt4B2RU40 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prrt4B2RU40 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prrt4B2RU40 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prrt4B2RU40 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prrt4B2RU40 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prrt4B2RU40 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prrt4B2RU40 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prrt4B2RU40 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prrt4B2RU40 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prrt4B2RU40 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prrt4B2RU40 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prrt4B2RU40 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prrt4B2RU40 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prrt4B2RU40 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prrt4B2RU40 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prrt4B2RU40 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prrt4B2RU40 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prrt4B2RU40 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prrt4B2RU40 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prrt4B2RU40 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prrt4B2RU40 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prrt4B2RU40 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prrt4B2RU40 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prrt4B2RU40 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Prrt4B2RU40 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prrt4B2RU40 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prrt4B2RU40 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prrt4B2RU40 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prrt4B2RU40 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Prrt4B2RU40 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prrt4B2RU40 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prrt4B2RU40 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prrt4B2RU40 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms