Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BC035947B2RQY6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC035947B2RQY6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC035947B2RQY6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC035947B2RQY6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC035947B2RQY6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC035947B2RQY6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC035947B2RQY6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC035947B2RQY6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC035947B2RQY6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BC035947B2RQY6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC035947B2RQY6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BC035947B2RQY6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BC035947B2RQY6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC035947B2RQY6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC035947B2RQY6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC035947B2RQY6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC035947B2RQY6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC035947B2RQY6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC035947B2RQY6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC035947B2RQY6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC035947B2RQY6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BC035947B2RQY6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BC035947B2RQY6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BC035947B2RQY6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BC035947B2RQY6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BC035947B2RQY6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BC035947B2RQY6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BC035947B2RQY6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BC035947B2RQY6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BC035947B2RQY6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BC035947B2RQY6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BC035947B2RQY6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BC035947B2RQY6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BC035947B2RQY6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BC035947B2RQY6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BC035947B2RQY6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BC035947B2RQY6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BC035947B2RQY6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC035947B2RQY6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC035947B2RQY6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BC035947B2RQY6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC035947B2RQY6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BC035947B2RQY6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BC035947B2RQY6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC035947B2RQY6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC035947B2RQY6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BC035947B2RQY6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BC035947B2RQY6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BC035947B2RQY6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BC035947B2RQY6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BC035947B2RQY6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BC035947B2RQY6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BC035947B2RQY6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BC035947B2RQY6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BC035947B2RQY6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BC035947B2RQY6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BC035947B2RQY6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BC035947B2RQY6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BC035947B2RQY6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BC035947B2RQY6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BC035947B2RQY6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BC035947B2RQY6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BC035947B2RQY6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BC035947B2RQY6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BC035947B2RQY6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
BC035947B2RQY6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BC035947B2RQY6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BC035947B2RQY6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BC035947B2RQY6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BC035947B2RQY6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BC035947B2RQY6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BC035947B2RQY6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC035947B2RQY6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC035947B2RQY6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC035947B2RQY6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC035947B2RQY6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC035947B2RQY6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC035947B2RQY6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC035947B2RQY6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC035947B2RQY6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC035947B2RQY6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC035947B2RQY6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC035947B2RQY6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC035947B2RQY6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC035947B2RQY6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC035947B2RQY6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC035947B2RQY6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC035947B2RQY6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC035947B2RQY6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BC035947B2RQY6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BC035947B2RQY6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC035947B2RQY6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC035947B2RQY6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BC035947B2RQY6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC035947B2RQY6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC035947B2RQY6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BC035947B2RQY6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BC035947B2RQY6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BC035947B2RQY6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms