Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Otud3B1AZ99 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Otud3B1AZ99 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Otud3B1AZ99 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Otud3B1AZ99 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Otud3B1AZ99 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Otud3B1AZ99 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Otud3B1AZ99 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Otud3B1AZ99 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Otud3B1AZ99 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Otud3B1AZ99 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Otud3B1AZ99 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otud3B1AZ99 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Otud3B1AZ99 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Otud3B1AZ99 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Otud3B1AZ99 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Otud3B1AZ99 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Otud3B1AZ99 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Otud3B1AZ99 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Otud3B1AZ99 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Otud3B1AZ99 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Otud3B1AZ99 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud3B1AZ99 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud3B1AZ99 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otud3B1AZ99 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otud3B1AZ99 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otud3B1AZ99 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Otud3B1AZ99 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud3B1AZ99 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud3B1AZ99 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud3B1AZ99 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud3B1AZ99 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otud3B1AZ99 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Otud3B1AZ99 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud3B1AZ99 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud3B1AZ99 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud3B1AZ99 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud3B1AZ99 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Otud3B1AZ99 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Otud3B1AZ99 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otud3B1AZ99 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otud3B1AZ99 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otud3B1AZ99 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otud3B1AZ99 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Otud3B1AZ99 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud3B1AZ99 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otud3B1AZ99 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Otud3B1AZ99 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otud3B1AZ99 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Otud3B1AZ99 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Otud3B1AZ99 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Otud3B1AZ99 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otud3B1AZ99 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otud3B1AZ99 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otud3B1AZ99 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otud3B1AZ99 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Otud3B1AZ99 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otud3B1AZ99 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Otud3B1AZ99 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otud3B1AZ99 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otud3B1AZ99 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otud3B1AZ99 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otud3B1AZ99 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud3B1AZ99 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud3B1AZ99 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Otud3B1AZ99 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otud3B1AZ99 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otud3B1AZ99 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otud3B1AZ99 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otud3B1AZ99 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otud3B1AZ99 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud3B1AZ99 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud3B1AZ99 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud3B1AZ99 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud3B1AZ99 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud3B1AZ99 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud3B1AZ99 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud3B1AZ99 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud3B1AZ99 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud3B1AZ99 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud3B1AZ99 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Otud3B1AZ99 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud3B1AZ99 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud3B1AZ99 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud3B1AZ99 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud3B1AZ99 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud3B1AZ99 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud3B1AZ99 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud3B1AZ99 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud3B1AZ99 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud3B1AZ99 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Otud3B1AZ99 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Otud3B1AZ99 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Otud3B1AZ99 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otud3B1AZ99 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otud3B1AZ99 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Otud3B1AZ99 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Otud3B1AZ99 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otud3B1AZ99 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Otud3B1AZ99 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms