Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Mbd5B1AYB6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Mbd5B1AYB6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Mbd5B1AYB6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Mbd5B1AYB6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Mbd5B1AYB6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Mbd5B1AYB6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Mbd5B1AYB6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Mbd5B1AYB6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Mbd5B1AYB6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Mbd5B1AYB6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Mbd5B1AYB6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Mbd5B1AYB6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Mbd5B1AYB6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Mbd5B1AYB6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Mbd5B1AYB6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Mbd5B1AYB6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Mbd5B1AYB6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Mbd5B1AYB6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Mbd5B1AYB6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Mbd5B1AYB6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Mbd5B1AYB6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Mbd5B1AYB6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Mbd5B1AYB6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Mbd5B1AYB6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Mbd5B1AYB6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Mbd5B1AYB6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Mbd5B1AYB6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Mbd5B1AYB6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Mbd5B1AYB6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Mbd5B1AYB6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Mbd5B1AYB6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Mbd5B1AYB6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Mbd5B1AYB6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Mbd5B1AYB6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Mbd5B1AYB6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Mbd5B1AYB6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Mbd5B1AYB6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
Mbd5B1AYB6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Mbd5B1AYB6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
Mbd5B1AYB6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Mbd5B1AYB6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Mbd5B1AYB6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Mbd5B1AYB6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Mbd5B1AYB6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Mbd5B1AYB6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Mbd5B1AYB6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Mbd5B1AYB6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Mbd5B1AYB6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Mbd5B1AYB6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Mbd5B1AYB6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Mbd5B1AYB6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Mbd5B1AYB6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Mbd5B1AYB6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Mbd5B1AYB6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Mbd5B1AYB6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Mbd5B1AYB6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Mbd5B1AYB6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Mbd5B1AYB6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Mbd5B1AYB6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Mbd5B1AYB6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Mbd5B1AYB6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Mbd5B1AYB6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Mbd5B1AYB6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Mbd5B1AYB6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Mbd5B1AYB6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Mbd5B1AYB6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Mbd5B1AYB6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Mbd5B1AYB6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Mbd5B1AYB6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Mbd5B1AYB6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Mbd5B1AYB6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Mbd5B1AYB6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Mbd5B1AYB6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Mbd5B1AYB6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Mbd5B1AYB6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Mbd5B1AYB6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Mbd5B1AYB6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Mbd5B1AYB6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Mbd5B1AYB6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Mbd5B1AYB6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Mbd5B1AYB6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Mbd5B1AYB6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Mbd5B1AYB6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Mbd5B1AYB6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Mbd5B1AYB6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Mbd5B1AYB6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Mbd5B1AYB6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Mbd5B1AYB6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Mbd5B1AYB6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Mbd5B1AYB6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Mbd5B1AYB6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Mbd5B1AYB6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Mbd5B1AYB6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Mbd5B1AYB6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Mbd5B1AYB6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Mbd5B1AYB6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Mbd5B1AYB6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Mbd5B1AYB6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Mbd5B1AYB6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms