Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PtpruB1AUH1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PtpruB1AUH1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PtpruB1AUH1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PtpruB1AUH1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PtpruB1AUH1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PtpruB1AUH1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PtpruB1AUH1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PtpruB1AUH1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PtpruB1AUH1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PtpruB1AUH1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PtpruB1AUH1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
PtpruB1AUH1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PtpruB1AUH1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PtpruB1AUH1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PtpruB1AUH1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PtpruB1AUH1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PtpruB1AUH1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PtpruB1AUH1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PtpruB1AUH1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PtpruB1AUH1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PtpruB1AUH1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PtpruB1AUH1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PtpruB1AUH1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PtpruB1AUH1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PtpruB1AUH1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PtpruB1AUH1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PtpruB1AUH1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PtpruB1AUH1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PtpruB1AUH1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PtpruB1AUH1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PtpruB1AUH1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PtpruB1AUH1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PtpruB1AUH1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PtpruB1AUH1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PtpruB1AUH1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PtpruB1AUH1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
PtpruB1AUH1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PtpruB1AUH1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PtpruB1AUH1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PtpruB1AUH1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PtpruB1AUH1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PtpruB1AUH1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PtpruB1AUH1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PtpruB1AUH1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PtpruB1AUH1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PtpruB1AUH1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PtpruB1AUH1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PtpruB1AUH1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PtpruB1AUH1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PtpruB1AUH1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PtpruB1AUH1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PtpruB1AUH1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PtpruB1AUH1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PtpruB1AUH1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PtpruB1AUH1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PtpruB1AUH1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PtpruB1AUH1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PtpruB1AUH1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PtpruB1AUH1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PtpruB1AUH1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PtpruB1AUH1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PtpruB1AUH1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PtpruB1AUH1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PtpruB1AUH1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PtpruB1AUH1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PtpruB1AUH1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PtpruB1AUH1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PtpruB1AUH1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PtpruB1AUH1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PtpruB1AUH1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PtpruB1AUH1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PtpruB1AUH1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PtpruB1AUH1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PtpruB1AUH1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PtpruB1AUH1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PtpruB1AUH1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PtpruB1AUH1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PtpruB1AUH1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PtpruB1AUH1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PtpruB1AUH1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PtpruB1AUH1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PtpruB1AUH1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
PtpruB1AUH1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PtpruB1AUH1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PtpruB1AUH1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PtpruB1AUH1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PtpruB1AUH1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PtpruB1AUH1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PtpruB1AUH1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PtpruB1AUH1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PtpruB1AUH1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PtpruB1AUH1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PtpruB1AUH1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PtpruB1AUH1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
PtpruB1AUH1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PtpruB1AUH1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtpruB1AUH1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtpruB1AUH1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PtpruB1AUH1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
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