Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700042G07RikB1AUF7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700042G07RikB1AUF7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
1700042G07RikB1AUF7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700042G07RikB1AUF7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700042G07RikB1AUF7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700042G07RikB1AUF7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700042G07RikB1AUF7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700042G07RikB1AUF7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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