Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Prr29B1ARI9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Prr29B1ARI9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Prr29B1ARI9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Prr29B1ARI9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Prr29B1ARI9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Prr29B1ARI9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Prr29B1ARI9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Prr29B1ARI9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Prr29B1ARI9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Prr29B1ARI9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Prr29B1ARI9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Prr29B1ARI9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Prr29B1ARI9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Prr29B1ARI9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Prr29B1ARI9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Prr29B1ARI9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Prr29B1ARI9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Prr29B1ARI9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Prr29B1ARI9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Prr29B1ARI9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Prr29B1ARI9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Prr29B1ARI9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Prr29B1ARI9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Prr29B1ARI9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Prr29B1ARI9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Prr29B1ARI9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Prr29B1ARI9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Prr29B1ARI9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Prr29B1ARI9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Prr29B1ARI9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Prr29B1ARI9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Prr29B1ARI9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Prr29B1ARI9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Prr29B1ARI9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Prr29B1ARI9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Prr29B1ARI9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Prr29B1ARI9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Prr29B1ARI9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prr29B1ARI9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Prr29B1ARI9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Prr29B1ARI9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Prr29B1ARI9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Prr29B1ARI9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Prr29B1ARI9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Prr29B1ARI9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Prr29B1ARI9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Prr29B1ARI9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Prr29B1ARI9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Prr29B1ARI9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Prr29B1ARI9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Prr29B1ARI9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prr29B1ARI9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prr29B1ARI9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Prr29B1ARI9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Prr29B1ARI9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Prr29B1ARI9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Prr29B1ARI9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Prr29B1ARI9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Prr29B1ARI9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Prr29B1ARI9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Prr29B1ARI9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Prr29B1ARI9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Prr29B1ARI9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Prr29B1ARI9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Prr29B1ARI9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Prr29B1ARI9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Prr29B1ARI9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Prr29B1ARI9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Prr29B1ARI9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Prr29B1ARI9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Prr29B1ARI9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Prr29B1ARI9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Prr29B1ARI9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Prr29B1ARI9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Prr29B1ARI9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Prr29B1ARI9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Prr29B1ARI9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Prr29B1ARI9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Prr29B1ARI9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Prr29B1ARI9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Prr29B1ARI9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Prr29B1ARI9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Prr29B1ARI9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Prr29B1ARI9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Prr29B1ARI9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Prr29B1ARI9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Prr29B1ARI9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Prr29B1ARI9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Prr29B1ARI9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Prr29B1ARI9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Prr29B1ARI9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Prr29B1ARI9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Prr29B1ARI9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Prr29B1ARI9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Prr29B1ARI9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Prr29B1ARI9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Prr29B1ARI9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Prr29B1ARI9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Prr29B1ARI9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms