Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Odf2A3KGV1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Odf2A3KGV1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Odf2A3KGV1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Odf2A3KGV1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Odf2A3KGV1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Odf2A3KGV1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Odf2A3KGV1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Odf2A3KGV1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Odf2A3KGV1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Odf2A3KGV1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Odf2A3KGV1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Odf2A3KGV1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Odf2A3KGV1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Odf2A3KGV1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Odf2A3KGV1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Odf2A3KGV1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Odf2A3KGV1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Odf2A3KGV1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Odf2A3KGV1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Odf2A3KGV1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Odf2A3KGV1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Odf2A3KGV1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Odf2A3KGV1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Odf2A3KGV1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Odf2A3KGV1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Odf2A3KGV1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Odf2A3KGV1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Odf2A3KGV1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Odf2A3KGV1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Odf2A3KGV1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Odf2A3KGV1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Odf2A3KGV1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Odf2A3KGV1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Odf2A3KGV1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Odf2A3KGV1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Odf2A3KGV1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Odf2A3KGV1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Odf2A3KGV1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Odf2A3KGV1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Odf2A3KGV1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Odf2A3KGV1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Odf2A3KGV1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Odf2A3KGV1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Odf2A3KGV1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Odf2A3KGV1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Odf2A3KGV1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Odf2A3KGV1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Odf2A3KGV1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Odf2A3KGV1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Odf2A3KGV1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Odf2A3KGV1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Odf2A3KGV1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Odf2A3KGV1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Odf2A3KGV1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Odf2A3KGV1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Odf2A3KGV1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Odf2A3KGV1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Odf2A3KGV1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Odf2A3KGV1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Odf2A3KGV1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Odf2A3KGV1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Odf2A3KGV1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Odf2A3KGV1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Odf2A3KGV1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Odf2A3KGV1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Odf2A3KGV1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Odf2A3KGV1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Odf2A3KGV1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Odf2A3KGV1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Odf2A3KGV1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Odf2A3KGV1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Odf2A3KGV1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Odf2A3KGV1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Odf2A3KGV1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Odf2A3KGV1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Odf2A3KGV1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Odf2A3KGV1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Odf2A3KGV1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Odf2A3KGV1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Odf2A3KGV1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Odf2A3KGV1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Odf2A3KGV1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Odf2A3KGV1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Odf2A3KGV1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Odf2A3KGV1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Odf2A3KGV1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Odf2A3KGV1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Odf2A3KGV1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Odf2A3KGV1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Odf2A3KGV1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Odf2A3KGV1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Odf2A3KGV1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Odf2A3KGV1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Odf2A3KGV1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Odf2A3KGV1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Odf2A3KGV1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Odf2A3KGV1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Odf2A3KGV1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Odf2A3KGV1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms