Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Palm3A2TJV2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Palm3A2TJV2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Palm3A2TJV2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Palm3A2TJV2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Palm3A2TJV2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Palm3A2TJV2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Palm3A2TJV2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Palm3A2TJV2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Palm3A2TJV2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Palm3A2TJV2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Palm3A2TJV2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Palm3A2TJV2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Palm3A2TJV2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Palm3A2TJV2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Palm3A2TJV2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Palm3A2TJV2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Palm3A2TJV2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Palm3A2TJV2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Palm3A2TJV2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Palm3A2TJV2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Palm3A2TJV2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Palm3A2TJV2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Palm3A2TJV2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Palm3A2TJV2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Palm3A2TJV2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Palm3A2TJV2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Palm3A2TJV2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Palm3A2TJV2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Palm3A2TJV2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Palm3A2TJV2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Palm3A2TJV2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Palm3A2TJV2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Palm3A2TJV2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Palm3A2TJV2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Palm3A2TJV2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Palm3A2TJV2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Palm3A2TJV2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Palm3A2TJV2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Palm3A2TJV2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Palm3A2TJV2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Palm3A2TJV2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Palm3A2TJV2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Palm3A2TJV2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Palm3A2TJV2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Palm3A2TJV2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Palm3A2TJV2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Palm3A2TJV2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Palm3A2TJV2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Palm3A2TJV2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Palm3A2TJV2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Palm3A2TJV2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Palm3A2TJV2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Palm3A2TJV2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Palm3A2TJV2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Palm3A2TJV2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Palm3A2TJV2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Palm3A2TJV2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Palm3A2TJV2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Palm3A2TJV2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Palm3A2TJV2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Palm3A2TJV2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Palm3A2TJV2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Palm3A2TJV2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Palm3A2TJV2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Palm3A2TJV2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Palm3A2TJV2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Palm3A2TJV2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Palm3A2TJV2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Palm3A2TJV2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Palm3A2TJV2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Palm3A2TJV2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Palm3A2TJV2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Palm3A2TJV2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Palm3A2TJV2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Palm3A2TJV2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Palm3A2TJV2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Palm3A2TJV2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Palm3A2TJV2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Palm3A2TJV2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Palm3A2TJV2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Palm3A2TJV2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Palm3A2TJV2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Palm3A2TJV2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Palm3A2TJV2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Palm3A2TJV2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Palm3A2TJV2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Palm3A2TJV2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Palm3A2TJV2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Palm3A2TJV2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Palm3A2TJV2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Palm3A2TJV2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Palm3A2TJV2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Palm3A2TJV2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Palm3A2TJV2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Palm3A2TJV2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Palm3A2TJV2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Palm3A2TJV2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Palm3A2TJV2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Palm3A2TJV2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms