Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms