Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syndig1A2ANU3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syndig1A2ANU3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syndig1A2ANU3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Syndig1A2ANU3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syndig1A2ANU3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syndig1A2ANU3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syndig1A2ANU3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Syndig1A2ANU3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syndig1A2ANU3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syndig1A2ANU3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syndig1A2ANU3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Syndig1A2ANU3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syndig1A2ANU3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syndig1A2ANU3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syndig1A2ANU3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syndig1A2ANU3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syndig1A2ANU3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syndig1A2ANU3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syndig1A2ANU3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Syndig1A2ANU3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Syndig1A2ANU3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Syndig1A2ANU3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syndig1A2ANU3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syndig1A2ANU3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syndig1A2ANU3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Syndig1A2ANU3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syndig1A2ANU3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syndig1A2ANU3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syndig1A2ANU3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syndig1A2ANU3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Syndig1A2ANU3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Syndig1A2ANU3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Syndig1A2ANU3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Syndig1A2ANU3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Syndig1A2ANU3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syndig1A2ANU3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syndig1A2ANU3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Syndig1A2ANU3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Syndig1A2ANU3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syndig1A2ANU3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syndig1A2ANU3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syndig1A2ANU3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Syndig1A2ANU3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Syndig1A2ANU3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syndig1A2ANU3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syndig1A2ANU3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syndig1A2ANU3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Syndig1A2ANU3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syndig1A2ANU3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syndig1A2ANU3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Syndig1A2ANU3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syndig1A2ANU3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syndig1A2ANU3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syndig1A2ANU3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syndig1A2ANU3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syndig1A2ANU3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syndig1A2ANU3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syndig1A2ANU3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syndig1A2ANU3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Syndig1A2ANU3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syndig1A2ANU3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syndig1A2ANU3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syndig1A2ANU3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Syndig1A2ANU3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syndig1A2ANU3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syndig1A2ANU3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syndig1A2ANU3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syndig1A2ANU3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syndig1A2ANU3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syndig1A2ANU3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syndig1A2ANU3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syndig1A2ANU3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syndig1A2ANU3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syndig1A2ANU3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syndig1A2ANU3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Syndig1A2ANU3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syndig1A2ANU3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syndig1A2ANU3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syndig1A2ANU3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syndig1A2ANU3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syndig1A2ANU3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syndig1A2ANU3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syndig1A2ANU3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syndig1A2ANU3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syndig1A2ANU3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Syndig1A2ANU3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syndig1A2ANU3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syndig1A2ANU3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syndig1A2ANU3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syndig1A2ANU3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syndig1A2ANU3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syndig1A2ANU3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syndig1A2ANU3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syndig1A2ANU3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syndig1A2ANU3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syndig1A2ANU3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syndig1A2ANU3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syndig1A2ANU3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syndig1A2ANU3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms