Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sdccag3A2AIW0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdccag3A2AIW0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdccag3A2AIW0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sdccag3A2AIW0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sdccag3A2AIW0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sdccag3A2AIW0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdccag3A2AIW0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdccag3A2AIW0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdccag3A2AIW0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdccag3A2AIW0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdccag3A2AIW0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Sdccag3A2AIW0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdccag3A2AIW0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sdccag3A2AIW0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Sdccag3A2AIW0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sdccag3A2AIW0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sdccag3A2AIW0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sdccag3A2AIW0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sdccag3A2AIW0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sdccag3A2AIW0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sdccag3A2AIW0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdccag3A2AIW0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sdccag3A2AIW0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdccag3A2AIW0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sdccag3A2AIW0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sdccag3A2AIW0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sdccag3A2AIW0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sdccag3A2AIW0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdccag3A2AIW0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdccag3A2AIW0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdccag3A2AIW0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdccag3A2AIW0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdccag3A2AIW0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdccag3A2AIW0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdccag3A2AIW0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdccag3A2AIW0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdccag3A2AIW0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdccag3A2AIW0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdccag3A2AIW0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdccag3A2AIW0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdccag3A2AIW0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdccag3A2AIW0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdccag3A2AIW0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdccag3A2AIW0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdccag3A2AIW0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdccag3A2AIW0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdccag3A2AIW0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdccag3A2AIW0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdccag3A2AIW0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdccag3A2AIW0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdccag3A2AIW0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdccag3A2AIW0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdccag3A2AIW0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdccag3A2AIW0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdccag3A2AIW0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdccag3A2AIW0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdccag3A2AIW0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdccag3A2AIW0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdccag3A2AIW0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdccag3A2AIW0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdccag3A2AIW0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdccag3A2AIW0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdccag3A2AIW0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdccag3A2AIW0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdccag3A2AIW0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdccag3A2AIW0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdccag3A2AIW0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdccag3A2AIW0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdccag3A2AIW0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdccag3A2AIW0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdccag3A2AIW0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sdccag3A2AIW0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sdccag3A2AIW0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdccag3A2AIW0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdccag3A2AIW0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdccag3A2AIW0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdccag3A2AIW0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdccag3A2AIW0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdccag3A2AIW0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdccag3A2AIW0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdccag3A2AIW0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdccag3A2AIW0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdccag3A2AIW0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdccag3A2AIW0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdccag3A2AIW0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sdccag3A2AIW0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sdccag3A2AIW0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdccag3A2AIW0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdccag3A2AIW0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdccag3A2AIW0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdccag3A2AIW0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdccag3A2AIW0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdccag3A2AIW0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdccag3A2AIW0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdccag3A2AIW0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdccag3A2AIW0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdccag3A2AIW0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdccag3A2AIW0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdccag3A2AIW0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms