Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem185aA2AF53 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem185aA2AF53 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem185aA2AF53 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem185aA2AF53 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem185aA2AF53 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem185aA2AF53 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem185aA2AF53 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem185aA2AF53 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem185aA2AF53 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem185aA2AF53 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem185aA2AF53 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem185aA2AF53 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem185aA2AF53 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem185aA2AF53 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem185aA2AF53 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem185aA2AF53 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem185aA2AF53 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem185aA2AF53 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem185aA2AF53 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem185aA2AF53 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem185aA2AF53 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmem185aA2AF53 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem185aA2AF53 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem185aA2AF53 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem185aA2AF53 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem185aA2AF53 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem185aA2AF53 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem185aA2AF53 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem185aA2AF53 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem185aA2AF53 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem185aA2AF53 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem185aA2AF53 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem185aA2AF53 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem185aA2AF53 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem185aA2AF53 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem185aA2AF53 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem185aA2AF53 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem185aA2AF53 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem185aA2AF53 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem185aA2AF53 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem185aA2AF53 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem185aA2AF53 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem185aA2AF53 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem185aA2AF53 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem185aA2AF53 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem185aA2AF53 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem185aA2AF53 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem185aA2AF53 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem185aA2AF53 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem185aA2AF53 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem185aA2AF53 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem185aA2AF53 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem185aA2AF53 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem185aA2AF53 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem185aA2AF53 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem185aA2AF53 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem185aA2AF53 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem185aA2AF53 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem185aA2AF53 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem185aA2AF53 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem185aA2AF53 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem185aA2AF53 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem185aA2AF53 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem185aA2AF53 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem185aA2AF53 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem185aA2AF53 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem185aA2AF53 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem185aA2AF53 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem185aA2AF53 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem185aA2AF53 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem185aA2AF53 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem185aA2AF53 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem185aA2AF53 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem185aA2AF53 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem185aA2AF53 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem185aA2AF53 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem185aA2AF53 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem185aA2AF53 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem185aA2AF53 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem185aA2AF53 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem185aA2AF53 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms