Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fbf1A2A870 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fbf1A2A870 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fbf1A2A870 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fbf1A2A870 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fbf1A2A870 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fbf1A2A870 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fbf1A2A870 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fbf1A2A870 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fbf1A2A870 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fbf1A2A870 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fbf1A2A870 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fbf1A2A870 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fbf1A2A870 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fbf1A2A870 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fbf1A2A870 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Fbf1A2A870 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fbf1A2A870 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fbf1A2A870 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fbf1A2A870 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Fbf1A2A870 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fbf1A2A870 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fbf1A2A870 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fbf1A2A870 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Fbf1A2A870 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fbf1A2A870 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fbf1A2A870 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Fbf1A2A870 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fbf1A2A870 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fbf1A2A870 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fbf1A2A870 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fbf1A2A870 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fbf1A2A870 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fbf1A2A870 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fbf1A2A870 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fbf1A2A870 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fbf1A2A870 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fbf1A2A870 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fbf1A2A870 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fbf1A2A870 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fbf1A2A870 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fbf1A2A870 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fbf1A2A870 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fbf1A2A870 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fbf1A2A870 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fbf1A2A870 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fbf1A2A870 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fbf1A2A870 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Fbf1A2A870 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fbf1A2A870 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fbf1A2A870 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fbf1A2A870 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fbf1A2A870 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fbf1A2A870 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fbf1A2A870 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fbf1A2A870 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fbf1A2A870 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Fbf1A2A870 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fbf1A2A870 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fbf1A2A870 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fbf1A2A870 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27■■□□□ 1.91
Fbf1A2A870 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Fbf1A2A870 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fbf1A2A870 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fbf1A2A870 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fbf1A2A870 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fbf1A2A870 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fbf1A2A870 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fbf1A2A870 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fbf1A2A870 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fbf1A2A870 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Fbf1A2A870 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fbf1A2A870 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Fbf1A2A870 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fbf1A2A870 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fbf1A2A870 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fbf1A2A870 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fbf1A2A870 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Fbf1A2A870 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fbf1A2A870 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fbf1A2A870 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fbf1A2A870 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fbf1A2A870 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fbf1A2A870 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fbf1A2A870 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fbf1A2A870 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fbf1A2A870 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fbf1A2A870 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fbf1A2A870 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fbf1A2A870 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fbf1A2A870 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fbf1A2A870 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Fbf1A2A870 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbf1A2A870 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbf1A2A870 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbf1A2A870 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fbf1A2A870 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fbf1A2A870 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fbf1A2A870 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fbf1A2A870 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms