Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc173A0JLY1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc173A0JLY1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc173A0JLY1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc173A0JLY1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc173A0JLY1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc173A0JLY1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc173A0JLY1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc173A0JLY1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc173A0JLY1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc173A0JLY1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc173A0JLY1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc173A0JLY1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc173A0JLY1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc173A0JLY1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc173A0JLY1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc173A0JLY1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc173A0JLY1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc173A0JLY1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc173A0JLY1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc173A0JLY1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc173A0JLY1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc173A0JLY1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc173A0JLY1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ccdc173A0JLY1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc173A0JLY1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc173A0JLY1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc173A0JLY1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc173A0JLY1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc173A0JLY1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc173A0JLY1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc173A0JLY1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc173A0JLY1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc173A0JLY1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc173A0JLY1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc173A0JLY1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc173A0JLY1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc173A0JLY1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc173A0JLY1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc173A0JLY1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc173A0JLY1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc173A0JLY1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc173A0JLY1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc173A0JLY1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc173A0JLY1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc173A0JLY1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc173A0JLY1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc173A0JLY1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc173A0JLY1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc173A0JLY1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc173A0JLY1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc173A0JLY1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc173A0JLY1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc173A0JLY1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc173A0JLY1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc173A0JLY1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc173A0JLY1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc173A0JLY1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc173A0JLY1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc173A0JLY1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc173A0JLY1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc173A0JLY1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc173A0JLY1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc173A0JLY1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc173A0JLY1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc173A0JLY1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc173A0JLY1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc173A0JLY1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc173A0JLY1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc173A0JLY1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc173A0JLY1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc173A0JLY1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc173A0JLY1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc173A0JLY1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc173A0JLY1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc173A0JLY1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc173A0JLY1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc173A0JLY1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc173A0JLY1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc173A0JLY1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc173A0JLY1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc173A0JLY1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc173A0JLY1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc173A0JLY1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc173A0JLY1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc173A0JLY1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc173A0JLY1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc173A0JLY1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc173A0JLY1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc173A0JLY1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc173A0JLY1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc173A0JLY1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc173A0JLY1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc173A0JLY1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc173A0JLY1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc173A0JLY1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccdc173A0JLY1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms