Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ino80eA0A0U1RP99 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ino80eA0A0U1RP99 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ino80eA0A0U1RP99 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ino80eA0A0U1RP99 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ino80eA0A0U1RP99 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ino80eA0A0U1RP99 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80eA0A0U1RP99 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80eA0A0U1RP99 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80eA0A0U1RP99 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80eA0A0U1RP99 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ino80eA0A0U1RP99 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ino80eA0A0U1RP99 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ino80eA0A0U1RP99 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ino80eA0A0U1RP99 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ino80eA0A0U1RP99 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ino80eA0A0U1RP99 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ino80eA0A0U1RP99 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ino80eA0A0U1RP99 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ino80eA0A0U1RP99 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80eA0A0U1RP99 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80eA0A0U1RP99 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ino80eA0A0U1RP99 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ino80eA0A0U1RP99 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ino80eA0A0U1RP99 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ino80eA0A0U1RP99 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ino80eA0A0U1RP99 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ino80eA0A0U1RP99 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80eA0A0U1RP99 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80eA0A0U1RP99 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ino80eA0A0U1RP99 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80eA0A0U1RP99 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80eA0A0U1RP99 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ino80eA0A0U1RP99 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80eA0A0U1RP99 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ino80eA0A0U1RP99 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ino80eA0A0U1RP99 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80eA0A0U1RP99 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80eA0A0U1RP99 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80eA0A0U1RP99 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80eA0A0U1RP99 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80eA0A0U1RP99 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80eA0A0U1RP99 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ino80eA0A0U1RP99 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ino80eA0A0U1RP99 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ino80eA0A0U1RP99 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ino80eA0A0U1RP99 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ino80eA0A0U1RP99 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ino80eA0A0U1RP99 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ino80eA0A0U1RP99 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ino80eA0A0U1RP99 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ino80eA0A0U1RP99 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ino80eA0A0U1RP99 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ino80eA0A0U1RP99 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ino80eA0A0U1RP99 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ino80eA0A0U1RP99 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ino80eA0A0U1RP99 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ino80eA0A0U1RP99 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ino80eA0A0U1RP99 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ino80eA0A0U1RP99 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ino80eA0A0U1RP99 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ino80eA0A0U1RP99 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ino80eA0A0U1RP99 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ino80eA0A0U1RP99 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ino80eA0A0U1RP99 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ino80eA0A0U1RP99 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ino80eA0A0U1RP99 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ino80eA0A0U1RP99 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ino80eA0A0U1RP99 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ino80eA0A0U1RP99 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ino80eA0A0U1RP99 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ino80eA0A0U1RP99 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ino80eA0A0U1RP99 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ino80eA0A0U1RP99 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ino80eA0A0U1RP99 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ino80eA0A0U1RP99 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ino80eA0A0U1RP99 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ino80eA0A0U1RP99 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ino80eA0A0U1RP99 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms