Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cited4Q9WUL8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cited4Q9WUL8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cited4Q9WUL8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms