Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod2Q9R0B9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plod2Q9R0B9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Plod2Q9R0B9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.3 ms