Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PalldQ9ET54 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PalldQ9ET54 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PalldQ9ET54 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PalldQ9ET54 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PalldQ9ET54 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PalldQ9ET54 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PalldQ9ET54 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PalldQ9ET54 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PalldQ9ET54 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms