Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx12Q9ER00 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stx12Q9ER00 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.7 ms