Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efhd1Q9D4J1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efhd1Q9D4J1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms