Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms